Hola Santiago,
Cualquiera de las dos opciones son válidas como proyecto final de carrera de Ingeniería Industrial Mecánica.
Además de la diferencia en previas, hay una gran diferencia en el tipo de actividad involucrada.
El "Proyecto" (2004) se basa en la realización de un Anteproyecto de una Planta Industrial (incluyendo análisis de mercado, localización, análisis de viabilidad económico-financiera, impactos ambientales, diseño de la planta con todas sus instalaciones y servicios).
El "Proyecto de Ingeniería Mecánica" (2054) es más libre en cuanto al tema de proyecto. Se han realizado proyectos de diseño de máquinas, diseños de dispositivos de generación de energía (eólica, hidráulica, solar), etc. En el repositorio de UdelaR (Colibrí) aparecen algunos de los proyectos realizados: https://www.colibri.udelar.edu.uy/jspui/handle/20.500.12008/28989 (ojo que acá están también los proyectos de fin de carrera de Ingeniería de Producción).
Otra diferencia es que el "Proyecto" (2004) inicia únicamente en marzo mientras que el "Proyecto de Ingeniería Mecánica" (2054) puede iniciar en marzo o en agosto.
Te recomiendo entrar a los EVAs de cada uno para buscar más información.
Saludos,
Rodolfo Pienika