Tarea 1 - Concepto de read

Tarea 1 - Concepto de read

de Sofia Tito Virgilio Rodriguez -
Número de respuestas: 1

Hola. 

Planificando la adaptación a fastq me surgió la duda sobre a qué se refería con "read" en la descripción del segmento 3 de secuencia de largos de reads.  

Yo había entendido que un read estaba conformado por las 4 líneas de texto descritas anteriormente, pero me parecía más eficiente enviar la secuencia de largos de las líneas de tipo 2, ya que con esos largos es suficiente para poder reconstruir el archivo. 

Ahí me entró la duda de si no habría entendido mal el concepto de read y de si en realidad un read se refería a una línea de tipo 2. 

Hago la consulta para confirmar si un read es una línea de tipo 2 y si la secuencia de largos que se espera en el segmento 3 es la secuencia de largos de las líneas de tipo 2. 

Gracias de antemano. 

Saludos!

En respuesta a Sofia Tito Virgilio Rodriguez

Re: Tarea 1 - Concepto de read

de Alvaro Martin -

Hola.

Es un poco confuso, pero se suele usar el término read para ambas cosas. 

Concretamente para el segmento 3 los largos que conviene codificar son los de las líneas de tipo 2.

Saludos,
Álvaro