Qué tal Martín?
Recordá que cuando escribimos 
estamos considerando el trabajo de la fuerza eléctrica.
Ahora, en el problema se dice que la partícula se mueve de forma cuasiestática de un punto a otro, lo que quiere decir que en todo momento la fuerza externa tendrá igual módulo pero dirección contraria a la fuerza eléctrica. Esto hace que el trabajo del agente externo tenga el signo opuesto al trabajo de la fuerza eléctrica.
Espero que esto te ayude a responder tu duda.
Saludos,
Daniel Gau.