Hola Santiago,
lo correcto es trabajar el problema como si fueran dos bobinas diferentes, con corrientes diferentes I1 e I2 para no cometer errores al derivar, sabiendo que al final tienen el mismo valor (porque es en verdad un único cable) pero no va a ser lo mismo derivar con respecto a I1 ó I2. Al calcular la autoinductancia de la bobina 1, por ejemplo, el flujo por esa rama debiera derivarse con respecto a la corriente que pasa por la bobina 1 únicamente, es decir I1, si desde el comienzo se hace I1=I2=I y se deriva con respecto a I, vamos a tener un valor de autoinductancia de la bobina 1 que depende del número de vueltas de la 2 y eso no tiene sentido. Lo correcto es tratarlas como I1 e I2 por separado (teneniendo presente al final, que valen lo mismo).
Saludos,
Julia.