Cree la carpeta /usr/local/share/lua/5.1 y en un principio instalo nixio bien. Pero cuando fui a ejecutar toribio me siguio dando que no encontraba nixio.so. Fui hasta las carpetas donde buscaba y note que en vez de tener el directorio /usr/local/lib/lua/5.1 tenia un ejecutable "5.1" en /usr/local/lib/lua/ que desconozco a que se debe.
Por lo tanto opte por la otra opción que fue modificar el archivo standalone.mk el cual es importado por el Makefile y alli le saque los "local" en las rutas de lua. Con lo cual copio los archivos compilados a estos directorios y puede ejecutar toribio sin problemas.
Gracias por la ayuda, saludos