Hola Santiago.
Da lo mismo cualquiera de las dos transformaciones.
Si eso se da en un contexto de resolución luego de la aplicación del CKY, la "tabla" asociada será distinta, pero el resultado final - si es o no una determinada frase generada por la gramática - será la misma. Es decir, lo que puede cambiar es el contenido de las celdas porque claramente las variables (y reglas) son distintas.
Saludos
Juanjo