Script para la cola de ejecución Slurp (cluserUY)

Script para la cola de ejecución Slurp (cluserUY)

de Eduardo Daniel Pérez Hunich -
Número de respuestas: 11

Buenas cómo andan?
Les cuento he tenido el problema de que no me encuentra el compilador de CUDA en clusterUY.
Desde soporte me hicieron el comentario que de quite ciertas partes del script y agregue otras.
Les comparto el script, espero que les sirva.

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#!/bin/bash
#SBATCH --job-name=gpgpu_practico_3_2
#SBATCH --ntasks=1
#SBATCH --mem=1G
#SBATCH --time=00:01:00
#SBATCH --partition=besteffort
#SBATCH --qos=besteffort_gpu
#SBATCH --gres=gpu:p100:1
#SBATCH --mail-type=ALL
#SBATCH --mail-user=<mail@mail.com>
#SBATCH -o salida.out

#export PATH=$PATH:/usr/local/cuda/bin.  <---- quitar
#export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/cuda/lib64. <---- quitar

source /etc/profile.d/modules.sh

module load cuda/11.0  #<---- agregar

cd /clusteruy/home/gpgpu1

$1 $2 $3 $4 $5 $6 $7 $8 $9 $10 $11 $12 $13 $14 $15

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Saludos,
Eduardo

En respuesta a Eduardo Daniel Pérez Hunich

Re: Script para la cola de ejecución Slurp (cluserUY)

de Guido Adrian Pereyra -
Buenos dias Eduardo,
A vos con esos cambios te funciona sin problemas? No estoy logrando hacerlo andar.

Les voy a escribir a los de soporte pero mientras queria asegurarme si habia algo mas.
Gracias!
En respuesta a Guido Adrian Pereyra

Re: Script para la cola de ejecución Slurp (cluserUY)

de Eduardo Daniel Pérez Hunich -

Hola Guido, me esta pasando exactamente lo mismo en este momento.
Por lo que tampoco estoy pudiendo correr mis scripts en el Cluster!
Tendremos que mandar mail a soporte@cluster.uy.

Abrazo! 
Eduardo

En respuesta a Eduardo Daniel Pérez Hunich

Re: Script para la cola de ejecución Slurp (cluserUY)

de Bruno Centanaro Garcia -
En respuesta a Bruno Centanaro Garcia

Re: Script para la cola de ejecución Slurp (cluserUY)

de Guido Adrian Pereyra -
Gracias por confirmar muchachos. Hace un rato les escribi a los de soporte, siendo fin de semana no se si vamos a tener suerte pero cualquier cosa aviso. Intente darle vueltas yo navegando por el file system y la verdad que no encuentro ningun path de CUDA para agregar a la variable PATH lamentablemente.
En respuesta a Bruno Centanaro Garcia

Re: Script para la cola de ejecución Slurp (cluserUY)

de Agustin Emiliano Nuñez Molina -
Buenas, ejecuté un ls en el directorio /usr/local/ dentro del cluster y no se encuentra el directorio cuda que está en el script.



Cambiando el directorio cuda a cuda-12.1 dentro del script debería funcionar.

export PATH=$PATH:/usr/local/cuda-12.1/bin
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/cuda-12.1/lib64

A mí con esta configuración me funciona, también agrego que estoy usando la gpu en modo interactivo (no sé si cambia en algo).
En respuesta a Agustin Emiliano Nuñez Molina

Re: Script para la cola de ejecución Slurp (cluserUY)

de Agustin Gamio Falagian -

Buenas, intente buscar en el directorio que indicaste pero no esta.

Adjunto Captura de Pantalla 2024-04-27 a la(s) 15.51.17.png
En respuesta a Agustin Gamio Falagian

Re: Script para la cola de ejecución Slurp (cluserUY)

de Agustin Emiliano Nuñez Molina -
Si querés probar el comando deberías tirarlo en un nodo que tenga gpu y no en el login. Igualmente con editar el script agregando los exports que pase ahí arriba ya debería funcionar.
En respuesta a Agustin Emiliano Nuñez Molina

Re: Script para la cola de ejecución Slurp (cluserUY)

de Agustin Gamio Falagian -
Gracias, como hiciste para entrar a un nodo?
En respuesta a Agustin Gamio Falagian

Re: Script para la cola de ejecución Slurp (cluserUY)

de Agustin Emiliano Nuñez Molina -
Seguí lo que está publicado en la web del cluster, acá te dejo el link https://cluster.uy/ayuda/como_ejecutar/#trabajo-interactivo-con-gpu