abajo toda la info,
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Claudina
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Queremos invitarles a la presentación del proyecto de fin de carrera de Federico Aicardi y Rodrigo Céspedes, titulado "Desarrollo de herramienta para visualización y análisis de evolución de virus". Este es un proyecto compartido entre un estudiante del IIE y otro del INCO, y forma parte de una línea de investigación de algunos años ya con investigadores del IMERL, FCien e IPMon.
Tutores: Maine Fariello (IMERL), Lorena Etcheverry (INCO) y Federico Lecumberry (IIE).
El tribunal está integrado por Matías Di Martino (IIE-IFFI/Duke), Ewelina Bakala (INCO), Ernesto Dufrechou (INCO) y Gonzalo Moratorio (FCien).
La presentación será por zoom y los detalles de conexión son los siguientes:
Día: lunes 28 de diciembre de 2020
Hora: 14:00
Como resultado se obtuvo una herramienta que integra todas estas aproximaciones brindando una interfaz al usuario. Se realizaron pruebas con un conjunto de datos conocidos, logrando obtener información de interés ya relevada.
La presentación será por zoom y los detalles de conexión son los siguientes:
Día: lunes 28 de diciembre de 2020
Hora: 14:00
https://us02web.zoom.us/j/84686002724?pwd=UldLajdJTUhQbjlWbXhCZlhUakVTZz09
Meeting ID: 846 8600 2724
Passcode: 163017
Meeting ID: 846 8600 2724
Passcode: 163017
Resumen:
El estudio de poblaciones de virus de ARN es una tarea desafiante dada su habilidad para evolucionar rápidamente y evadir la respuesta inmune del huésped, basada en la variabilidad genética extrema. El surgimiento de las tecnologías de NGS (Next Generation Sequencing) ha provocado que la adquisición de datos de evolución de poblaciones de virus a lo largo del tiempo sea factible. La dificultad recae en la cantidad y estructura de los datos. El análisis de datos evolutivos de virus es particularmente útil para medir la capacidad mutacional de los virus y su habilidad para adaptarse a nuevos ambientes.
A partir del trabajo "Análisis y Visualización de la Evolución de Virus" [31] en este proyecto se desarrolla una herramienta para analizar y visualizar los datos obtenidos por experimentos evolutivos de distintas especies de arbovirus, con el fin de poder entender los mecanismos que subyacen la adaptación de estos virus a distintos ambientes. Se desarrollaron dos nuevas aproximaciones metodológicas, una con una componente más visual y otra más analítica.
Como resultado se obtuvo una herramienta que integra todas estas aproximaciones brindando una interfaz al usuario. Se realizaron pruebas con un conjunto de datos conocidos, logrando obtener información de interés ya relevada.
Saludos,
-- Federico Lecumberry