# Importar biblioteca de Python.
import numpy as np
# Valor de Percentil buscado.
vValorPercentil = 5.0
# Raster del analisis en la Tabla de Contenidos
vNombreRaster = "rasSolucion"
# Que valor le vamos a dar al NoData ?
vValorNoData = -1000
# Convierto mi raster en una matriz de dobles.
vArray = arcpy.RasterToNumPyArray(vNombreRaster, nodata_to_value = vValorNoData)
# Filtro la matriz: excluyo los valores que son iguales a NoData.
vArray = vArray [vArray != vValorNoData]
# Ordeno la Matriz.
vArray = np.sort(vArray)
# Calculo el percentil.
vPercentil = vArray[int(np.size(vArray) * vValorPercentil / 100.0)]
# Presento el Resultado.
print('Valor de Percentil Buscado = ', vPercentil)