Hola
si tu señal de entrada es U entonces lo que está "hacia adelante" forma parte del proceso. Por supuesto que en términos de la trasmisión física las señalas probablemente sean eléctricas, pero en definitiva asumimos una proporcionalidad entre la señal eléctrica y la entrada (en este caso velocidad del motor), y entonces se puede asumir que la salida del controlador es directamente la variable de entrada.
Si tu señal de entrada es un caudal que "sale" del motor como tu dices entonces tienes que incluir en forma explícita la función de transferencia de ese motor.
saludos