Hola Martín,
Cuando el ejercicio dice "cilindro muy largo", pretende que desprecies los efectos en los bordes (el este caso lo que vendrían a ser las tapas). Por lo tanto, podés considerar que estás trabajando con un cilindro infinito.
Las coordenadas cilíndricas las podemos definir como r (distancia al eje), theta (angulo) y la altura z (que en este caso coincide con el largo). Adjunto figura.
El ser infinito tiene como consecuencia que no existirá una preferencia en la dirección z (si me muevo a lo largo, siempre veo lo mismo). Esto implica que el campo no puede tener una componente en esa dirección.
Lo mismo sucede si te movés en theta, pero pasa algo distinto con r. Si te moves en r te alejás de la carga.
Entonces, el campo sólo tiene componente r y sólo depende de esa coordenada.
Lo que yo te propuse, es que una vez fijada la superficie gaussiana, el módulo de r está fijo, y por eso el módulo del campo es constante en toda la superficie.
Luego, ese resultado vale para cualquier r dentro de determinado rango.