Parece estar buscando un programa bajo el directorio "C:\Program Files" y que el nombre del archivo le queda cortado en el espacio.
Instalaste algo en "Program Files"?
Para tener más información hace lo siguiente: en Notepad++ desmarcá la opción "Plugins > nppexec > No internal messages".
Luego intentá de nuevo Grabar sistema en FPGA y mirá los mensajes en la consola del Notepad++
julio