NOP es una instrucción que no hace nada, consume algunos ciclos como cualquier instrucción.
NO consume ciclos de reloj hasta finalizar el programa.
Está bien pensar en una instrucción que termine la ejecución, usualmente las arquitecturas cuentan con una. Si estás programando una función, se ejecuta el retorno (en 8086 por ejemplo es RET).
En algunos casos, las arquitecturas cuentan con algunas instrucciones para detener la ejecución (ej: HALT).
Saludos.