P:¿un contador de modulo 6 es una maquina de estado en modo de ciclo que tiene 6 estado diferentes no?
R: Cuando está en régimen pasa por 6 estados diferentes.
P:¿pero no importa de que estado a que estado pasa?
R: En el caso genérico, no importa.
P: ¿como planteo el diagrama de estados si no se de que estado a que estado llevar el contador en cada señal de reloj?
R: Podés trabajar con los estados asignados de antemano, o sea, en lugar de llamarle "Q0" le llamás "000" (o la asignación que consideres), idem para los otros estados. Luego la tabla de estados va a quedar con los las variables de estado asignadas.
También podés trabajar con Q0, Q1.... y luego asignar las variables conveniente a tus interés.
Javier