Efectivamente, la opción válida (desde el punto de vista formal del RFC 1034) es Alternativa 2. La RFC habla de que un nombre primario no debería tener aliases diferentes y nombra algún ejemplo del por qué. Dado lo anterior, las preguntas que planteas sobre la Alternativa 1 no tienen sentido por no ser un escenario válido (al menos de forma estándard).
Sobre la pregunta general, es cierto que en el ejemplo no se aprecia el potencial que tiene. En el caso tal como está mostrado, parece que todo está bajo el mismo dominio (y administración) lo que permite que eventualmente uno sepa todas las IPs y podría no usar los CNAME. Pero en un escenario general, el cname permite que hagas referencia a un nombre primario que puede no estar bajo tu dominio y hasta puede tener IPs que cambien. Si no usas CNAME, en estos escenarios no tendrías forma de poner todas las IPs ni de que se maneje con cierta automatización ante cambios de RRs que hagan esos servidores para sus registros.
Martín