Cambiar una entrada justo cuando viene el reloj puede dar problemas, esa suposición es correcta.
Con respecto a la parte C, la solución que se publicó hoy sigue teniendo algunos problemas de rebotes de los botones. Esto no lo tienen que solucionar ustedes.
Simulen el circuito de Control para verificar que anda bien, pero no se preocupen si en la placa salta.