Buenas!
Creo que hacen referencia a la nota que se encuentra en un recuadro gris, previo a la descripción de esperoflanco. Lo que se busca es que antes de comenzar tu loop principal en los programas de prueba, ambas señales de salida para las que implementaron el hardware inicien con un valor conocido, en particular en este caso deben estar en nivel alto.
Otro puerto de salida que se podría inicializar serían los displays 7 segmentos, por ejemplo, uno podría inicializarlos apagados al comienzo del programa de prueba, y recién se prenderán una vez que quiera desplegar algo en ellos en mi loop principal.
Espero haber aclarado!
Saludos,
Manuel